La Prorrectoría es la unidad de apoyo directo a la gestión del Rector. Es liderada por la Prorrectora. En esta labor deberá velar por el alineamiento y coordinación de las distintas unidades con el proyecto académico de la Universidad, orientando la definición de políticas y articulando los distintos actores de la comunidad universitaria.
Las líneas para postular son Impacto (foco en proyectos hasta 20 millones de toda naturaleza artística o creativa), Preservación (dos modalidades con foco en patrimonio y su activación, hasta 6 millones) y Exploración (con tres modalidades, enfocadas en la movilidad nacional e internacional, hasta 2 millones, la difusión a través de eventos y publicaciones, hasta 6 millones y la experimentación de nuevas ideas, monto fijo de 2 millones).